Родился 1 декабря 1963 г. в г. Оса Пермского края в семье священника. В 1971-81 гг. учился в Чермозской средней школе имени Героя Советского Союза В.Е. Ершова (Пермский край).

В 1981 г. поступил в Одесскую духовную семинарию.

В 1982-84 гг. проходил действительную срочную службу в рядах Советской армии в военно-строительных войсках в звании рядового.

В 1984-87 гг. обучался в Московской духовной семинарии, параллельно проходил обучение в регентском классе при Московских духовных школах. В 1987 г. поступил в Московскую духовную академию.

В марте 1987 г. принят в число братии Свято-Троицкой Сергиевой лавры, где исполнял общие монастырские послушания.

3 июля 1987 г. наместником Свято-Троицкой Сергиевой лавры архимандритом Алексием (Кутеповым) пострижен в мантию с наречением имени Феофилакт в честь преподобного Феофилакта, исповедника, епископа Никомедийского.

16 июля 1987 г. в Успенском соборе Троице-Сергиевой лавры митрополитом Кишиневским и Молдавским Серапионом рукоположен в сан иеродиакона.

30 мая 1988 г. в Успенском соборе лавры архиепископом Зарайским Иовом рукоположен в сан иеромонаха.

После открытия в 1988 г. Введенского ставропигиального мужского монастыря Оптина пустынь по благословению Святейшего Патриарха Пимена был переведен в Оптину пустынь, где нес послушания казначея, экклесиарха, помощника благочинного, регента хора, уставщика, библиотекаря.

В 1988 г. переведен на обучение в СЗО Московской духовной академии, которую окончил в 2005 г.

В 1991-2009 гг. — настоятель храма Живоначальной Троицы в Останкине г. Москвы — подворья Оптиной пустыни в (с 1999 г. — Патриаршее подворье).

Решением Священного Синода в 1994 г. назначен членом Издательского Совета Русской Православной Церкви.

В 2001-07 гг. — член Епархиального совета г. Москвы. В 2001-08 гг. — председатель Богослужебной комиссии при Епархиальном совете г. Москвы.

В 2003-08 гг. — настоятель храма иконы Божией Матери «Отрада и Утешение» на Ходынском поле г. Москвы и благочинный храмов Всехсвятского округа г. Москвы.

В 2004 г. назначен духовным попечителем негосударственного образовательного учреждения «Православная классическая гимназия во имя иконы Божией Матери "Знамение" в Ховрине».

В мае 2008 г. указом Святейшего Патриарха Алексия II и решением Священного Синода от 23 июня 2008 г. назначен наместником Воскресенского Ново-Иерусалимского ставропигиального мужского монастыря. Тогда же определен членом Попечительского совета по восстановлению обители и утвержден заместителем председателя правления Благотворительного фонда по восстановлению Ново-Иерусалимского монастыря и заместителем председателя Экспертного совета при председателе Фонда.

С 2008 г. — действительный член Международной Кирилло-Мефодиевской академии славянского просвещения.

В 2016 г. возведен в сан архимандрита.